MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 6022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013416	TGA	2	6	180625	180630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013416	ATT	2	6	180637	180642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013416	T	6	6	181794	181799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013416	ATTAT	2	10	181841	181850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013416	AAT	2	6	181871	181876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013416	T	7	7	184109	184115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013416	GTT	2	6	184193	184198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013416	A	6	6	186155	186160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013416	T	6	6	186168	186173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013416	ACC	2	6	186817	186822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_013416	ATG	2	6	187296	187301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013416	T	7	7	187305	187311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013416	TTA	2	6	191935	191940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013416	T	6	6	192120	192125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013416	T	6	6	195294	195299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013416	CA	3	6	195300	195305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_013416	AGA	2	6	195408	195413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013416	A	6	6	196297	196302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013416	T	7	7	196318	196324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013416	GTT	2	6	196989	196994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013416	ATT	2	6	197157	197162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013416	CTT	2	6	197268	197273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013416	CA	3	6	197350	197355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_013416	T	7	7	197589	197595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013416	ACA	2	6	197709	197714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013416	ATTT	2	8	197722	197729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013416	T	6	6	197738	197743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013416	CAT	2	6	197753	197758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013416	TAA	2	6	197762	197767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013416	ATAA	2	8	197929	197936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013416	C	6	6	197950	197955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
532	NC_013416	TAT	2	6	198050	198055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013416	ATT	2	6	198115	198120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013416	TAAAA	2	10	198130	198139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013416	TATT	2	8	198181	198188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013416	TCA	2	6	198720	198725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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538	NC_013416	TAC	2	6	198760	198765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_013416	GAA	3	9	198804	198812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013416	TA	3	6	201649	201654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013416	CTTA	2	8	202321	202328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_013416	CAA	2	6	202892	202897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013416	ATTGTC	2	12	202908	202919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
544	NC_013416	TCA	3	9	203247	203255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013416	TTTGAA	2	12	203395	203406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013416	AATA	2	8	203442	203449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013416	GAA	2	6	203485	203490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013416	AGCGA	2	10	203556	203565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
549	NC_013416	GAA	2	6	203582	203587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013416	CTTT	2	8	203629	203636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_013416	CAA	2	6	203680	203685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_013416	AAAC	2	8	203716	203723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_013416	TCAC	2	8	203762	203769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_013416	CCG	2	6	203788	203793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_013416	ATA	2	6	203804	203809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013416	GAA	3	9	203844	203852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_013416	A	7	7	208689	208695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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561	NC_013416	T	6	6	211761	211766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013416	CTT	2	6	211767	211772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_013416	T	6	6	211790	211795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013416	T	7	7	211803	211809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013416	TA	3	6	211831	211836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013416	TTAT	2	8	211870	211877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013416	TGAT	2	8	211908	211915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013416	TAA	2	6	212006	212011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013416	TTA	2	6	212047	212052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013416	A	6	6	213658	213663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013416	ATCG	2	8	214811	214818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_013416	TATT	2	8	214838	214845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013416	TAA	2	6	214852	214857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013416	TAG	2	6	214869	214874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013416	TAA	2	6	214919	214924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013416	ATG	2	6	214953	214958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_013416	TGA	2	6	215154	215159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_013416	A	6	6	215215	215220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013416	A	6	6	215300	215305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013416	TAC	2	6	215316	215321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013416	ATCG	2	8	215336	215343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
585	NC_013416	TGA	2	6	215351	215356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013416	TTA	2	6	217205	217210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_013416	TTTG	2	8	217297	217304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013416	T	6	6	219888	219893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013416	A	7	7	219899	219905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013416	TAT	2	6	229103	229108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013416	T	7	7	230457	230463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013416	AAT	2	6	232260	232265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013416	A	6	6	236424	236429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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596	NC_013416	AACAG	2	10	237058	237067	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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598	NC_013416	CAA	2	6	237150	237155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_013416	A	7	7	237154	237160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013416	GAAA	2	8	237292	237299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013416	GAT	2	6	237336	237341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013416	TG	3	6	237344	237349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013416	A	7	7	237378	237384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013416	TTA	2	6	237530	237535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013416	TTTATC	2	12	237537	237548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
606	NC_013416	TGG	2	6	237629	237634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013416	GTG	2	6	237658	237663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013416	ATT	2	6	237759	237764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013416	ATG	2	6	237817	237822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013416	ATCA	2	8	237855	237862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_013416	AAT	2	6	238022	238027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013416	TAT	2	6	238044	238049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013416	TCT	2	6	238171	238176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013416	TTAC	2	8	238250	238257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_013416	TCC	2	6	238268	238273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_013416	TA	3	6	238308	238313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013416	T	6	6	238321	238326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013416	GGT	2	6	238530	238535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013416	ACC	2	6	238536	238541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_013416	CGC	2	6	238549	238554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_013416	TGA	2	6	238565	238570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013416	CT	3	6	238576	238581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_013416	CGCTTT	2	12	238590	238601	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013416	TC	3	6	238620	238625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_013416	TTCT	2	8	238627	238634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_013416	CTT	2	6	238635	238640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_013416	CTTCC	2	10	238642	238651	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
628	NC_013416	CTTC	2	8	238696	238703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_013416	TCT	2	6	238737	238742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013416	TCTTTC	4	24	238748	238771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_013416	TTTAA	2	10	238774	238783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013416	AC	3	6	238908	238913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_013416	CGTCTT	2	12	238926	238937	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013416	AAC	2	6	238939	238944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013416	TC	3	6	239015	239020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_013416	AGC	2	6	239103	239108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_013416	CCAA	2	8	239110	239117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_013416	ACG	2	6	239157	239162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013416	TGA	2	6	239237	239242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_013416	CCG	2	6	239265	239270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_013416	ACC	2	6	239352	239357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_013416	GCTT	2	8	239411	239418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
643	NC_013416	CTC	2	6	239471	239476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_013416	GAG	2	6	239490	239495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_013416	GGT	2	6	239575	239580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
647	NC_013416	ACT	2	6	239613	239618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_013416	GCC	2	6	239845	239850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_013416	GGCA	2	8	239916	239923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
652	NC_013416	TAA	2	6	239970	239975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_013416	CAGC	2	8	239983	239990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
654	NC_013416	TC	3	6	240098	240103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
655	NC_013416	ACC	2	6	240128	240133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
656	NC_013416	TCA	2	6	240227	240232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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658	NC_013416	CTAAC	2	10	240310	240319	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
659	NC_013416	CTT	2	6	240540	240545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_013416	CTTT	2	8	240788	240795	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
662	NC_013416	ATG	2	6	240798	240803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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665	NC_013416	GTT	2	6	240894	240899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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668	NC_013416	TCGGT	2	10	241139	241148	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
669	NC_013416	GTAC	2	8	241347	241354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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672	NC_013416	TTC	2	6	241469	241474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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674	NC_013416	CTTTCG	2	12	241612	241623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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677	NC_013416	CTT	2	6	241822	241827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
678	NC_013416	TAA	2	6	241951	241956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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680	NC_013416	AAT	2	6	242063	242068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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684	NC_013416	TGG	2	6	242155	242160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
685	NC_013416	CCT	2	6	242185	242190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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687	NC_013416	GTG	2	6	242279	242284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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734	NC_013416	T	7	7	244241	244247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_013416	A	7	7	255878	255884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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766	NC_013416	GTCC	2	8	256064	256071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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770	NC_013416	TAC	2	6	256257	256262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_013416	TAG	2	6	256476	256481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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773	NC_013416	T	6	6	257167	257172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_013416	TGA	2	6	257339	257344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
775	NC_013416	GTAAGA	2	12	257413	257424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
776	NC_013416	T	8	8	257455	257462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_013416	GGTAG	2	10	257463	257472	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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